故事發(fā)生在虛構(gòu)的未來(lái)世界，彼時(shí)，人類因?yàn)槭韬龊痛笠舛チ酥坪?quán)，海洋，成為了人們可望而不可即的所在，盤踞在那里的，是一股名為“深海棲艦”的強(qiáng)大勢(shì)力。為了同這股勢(shì)力抗?fàn)帲蝗好麨椤芭災(zāi)铩钡呐⒆觽兂霈F(xiàn)了，在她們的體內(nèi)，棲息著艦艇之魂，亦是明日呢化身成為各式各樣的戰(zhàn)艦，為了人類的和平做著不懈的努力。
　　平日里，艦?zāi)飩冊(cè)诿麨椤版?zhèn)守府”的大本營(yíng)里進(jìn)行日常生活和訓(xùn)練，某日，一位名叫吹雪（上坂堇 配音）的活潑女孩出現(xiàn)在了大家的面前，初來(lái)乍到的她躊躇滿志，熱情滿滿地加入了艦隊(duì)的新生活中去，在這里，充滿了精彩和刺激的日常就此展開(kāi)。

　　故事敘述一只叫暮光閃閃(TwilightSparkle meiju5.net)的小馬為了執(zhí)行導(dǎo)師塞拉斯提婭公主（PrincessCelestia）給她的任務(wù)，與助手斯穗龍（Spike）一起來(lái)到小馬鎮(zhèn)學(xué)習(xí)有關(guān)友誼的魔法的知識(shí)，其中她認(rèn)識(shí)了蘋果杰克（Applejack）、瑞瑞（Rarity）、小蝶（Fluttershy）、云寶黛西（RainbowDash）與碧琪（PinkiePie）五位好朋友，每只小馬都代表著友誼的每個(gè)元素，并在和諧水晶（E... 故事敘述一只叫暮光閃閃(TwilightSparkle)的小馬為了執(zhí)行導(dǎo)師塞拉斯提婭公主（PrincessCelestia）給她的任務(wù)，與助手斯穗龍（Spike）一起來(lái)到小馬鎮(zhèn)學(xué)習(xí)有關(guān)友誼的魔法的知識(shí)，其中她認(rèn)識(shí)了蘋果杰克（Applejack）、瑞瑞（Rarity）、小蝶（Fluttershy）、云寶黛西（RainbowDash）與碧琪（PinkiePie）五位好朋友，每只小馬都代表著友誼的每個(gè)元素，并在和諧水晶（ElementsofHarmony）中，各扮演重要的關(guān)鍵元素。此后，暮光閃閃(TwilightSparkle)便與她認(rèn)識(shí)的新朋友們開(kāi)始了有趣的日常生活，在第四季時(shí)暮光閃閃（TwilightSparkle）和她的五個(gè)朋友在第四集以及之后開(kāi)始寫日記。

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　　While still trying to adjust to her new role as the Princess of Friendship, Twilight and friends follow a map to a village where the inhabitants mysteriously have no talents and are equal in every way.

　　King Sombra曾經(jīng)統(tǒng)治小馬國(guó)邊緣的水晶王國(guó)，帶來(lái)了無(wú)盡的苦難。后來(lái)他被塞拉斯迪亞公主和露娜公主聯(lián)合擊敗，變成陰影，并被放逐。
　　一千年后，King Sombra卷土重來(lái)，想要重新統(tǒng)治水晶王國(guó)。大公主希望暮光閃閃一行去保護(hù)水晶王國(guó)，免受King Sombra的再度襲擊。他們克服重重困難和阻撓，去保護(hù)水晶王國(guó)，并讓那里再度恢復(fù)生機(jī)。

　　第一二集內(nèi)容：
　　King Sombra曾經(jīng)統(tǒng)治小馬國(guó)邊緣的水晶王國(guó)，帶來(lái)了無(wú)盡的苦難。后來(lái)他被塞拉斯迪亞公主和露娜公主聯(lián)合擊敗，變成陰影，并被放逐。一千年后，King Sombra卷土重來(lái)，想要重新統(tǒng)治水晶王國(guó)。大公主希望暮光閃閃(twilight sparkle)一行去保護(hù)水晶王國(guó)，免受King Sombra的再度襲擊。他們克服重重困難和阻撓，去保護(hù)水晶王國(guó)，并讓那里再度恢復(fù)生機(jī)。
　　第三季的制作團(tuán)隊(duì)基本保留了第二季的結(jié)構(gòu)，勞倫浮士德依然退出。
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　　MLP:FiM是什么？小馬迷是什么？——參考第一季劇情簡(jiǎn)介

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一千年前，血月當(dāng)空，空間裂縫開(kāi)啟，怪獸時(shí)代降臨！無(wú)數(shù)怪獸，肆虐全球，就在人類即將面臨著徹底滅亡的時(shí)刻，獸魂師的誕生，給全人類帶來(lái)了希望的曙光，伴隨著獸魂師的一代代傳承和發(fā)展，人類成功創(chuàng)造出了新的文明秩序來(lái)對(duì)抗怪獸的入侵！

　　住在森林深處，討厭與人往來(lái)的魔法師──亞倫，不但被稱作「魔王」，周遭的人也都對(duì)他感到多有畏懼。過(guò)著隱士生活的他，某天撿到了倒在路邊的千金──夏綠蒂。她被安上莫須有的罪名，更遭到悔婚，從祖國(guó)逃到這里來(lái)。
　　聽(tīng)聞這些原委的亞倫，回想起自己曾被深信是伙伴的成員背叛的苦澀經(jīng)驗(yàn)。聽(tīng)到她年僅十七歲，一直過(guò)著被人壓榨的生活，亞倫下定決心——
　　要讓她住在自己家里……灌輸她各種壞壞卻幸福的事情。

　　克勞斯在成功抓獲《尸》的同伙后返回陽(yáng)炎宮。
　　然而，在那里得知的卻是緹雅、莫妮卡、安妮特和愛(ài)爾娜選拔組的失蹤。
　　選拔組的女孩們?cè)诙燃贂r(shí)遇見(jiàn)了一位因失憶而來(lái)歷不明的女孩——安妮特的母親。
　　每個(gè)人都對(duì)重聚感到興奮，但這卻是分裂團(tuán)隊(duì)殘酷命運(yùn)的開(kāi)始。
　　失蹤少女的《秘密的任務(wù)》到底是什么？
　　世界最強(qiáng)的間諜們、世界最大的欺騙！