陽光明媚的一天，碧海藍(lán)天，海鷗飛翔，在一座植被茂密的小島上，漩渦鳴人、佐助、小櫻以及井野、志乃登一眾下忍沒有任何修煉任務(wù)，而是悠哉游哉地坐在海邊舉行燒烤聚會(huì)，只不過這群性格別扭的家伙卻分坐在不同地方，各自為政。超級(jí)貪吃的漩渦鳴人意外在沙灘下發(fā)現(xiàn)一支普普通通、破破爛爛的瓶子，他隨手打開瓶蓋，卻從里面噴出一股濃郁的煙霧。煙霧散去，一個(gè)身形巨大的怪大叔出現(xiàn)，他就是傳說中的壺中魔神，可以滿足人們?nèi)齻€(gè)愿望。
　　鳴人他們起初并不相信魔伸的說法，但在見識(shí)了對方的法力之后，卻不由得佩服起來。可惜他們有意無意浪費(fèi)了兩個(gè)愿望，而今只剩下最后一個(gè)，各懷私心的下忍們在島上展開了一場激烈的爭奪戰(zhàn)……

　　No demon is safe as Bogdan Boner, the alcohol-loving, self-taught exorcist-for-hire, returns with more inventive, obscene and deadly deeds.

在艾倫他們居住的帕拉迪島之外，還存在一個(gè)其他人類居住的世界。當(dāng)中一個(gè)國家「瑪雷」與其他各國爆發(fā)戰(zhàn)爭。陷入苦戰(zhàn)之際，他們決定要攻進(jìn)帕拉迪島，把「始祖的巨人」搶過來。在這里又看到另一群孩子們拼命求生存的身影……

　　所謂的“除妖”，即是把由于某些緣由而從原本應(yīng)在的“隱世”來到“現(xiàn)世”停留的妖怪們送回“隱世”這一工作。某天，被妖怪附體的高中生·蘆屋花繪，依靠偶然發(fā)現(xiàn)的聯(lián)絡(luò)方式，來到了專門除妖的物怪庵，在那里的是一臉不高興的店主安倍晴齋。由于某些緣故，蘆屋就這樣以物怪庵奉公人的身份開始工作……安倍與蘆屋的除妖組合和妖怪們的物語就此開幕。