故事發(fā)生在二十一世紀末，彼時，魔法早就已經不再僅存與神話和傳說之中，而是同科學與超能力融合，成為了人盡皆知的存在。國家甚至成立了魔法大學附屬第一高校，專門培養(yǎng)此方面的人才，以便更好的為國家效力。
　　司波達也（中村悠一 配音）和妹妹司波深雪（早見沙織 配音）是魔法高校的新生，深雪是能力優(yōu)秀的“花冠”，而達也則是作為其替補的二科生“雜草”。在學園中，兄妹兩人結識了許多有趣的同伴們——個性大大咧咧不拘小節(jié)的千葉艾麗卡（內山夕實 配音）、文靜膽小的柴田美月（佐藤聰美 配音）、正直勇敢的西城雷歐哈魯特（寺島拓篤 配音）、認真努力的吉田干比古（田丸篤志 配音），在學習的過程中，存在于學園之中的秘密也在逐漸揭曉。

　　位于東京西部的巨大“學園都市”。在總人口達230萬人，其中約8成是學生的這座都市中，實施著超能力開發(fā)的特殊課程，學生們的能力被給予從“無能力Level 0”到“超能力Level 5”的六階段評價。
　　高中生上條當麻，也是住在學園都市的學生之一。他由于隱藏在右手中的力量——只要是異能之力，就連神的加護都能消除的“幻想殺手Imagine Breaker”，而被評價為名落孫山的“無能力”，過著充滿不幸的人生。
　　而上條的學生生活，由于暑假開始時從天而降的純白修女而發(fā)生了巨大的變化。自從與逃離“魔法”世界的她——“禁書目錄茵蒂克絲”相遇開始，上條就被卷入了各種各樣的事件中。統(tǒng)率學園都市的“科學”方、與茵蒂克絲關聯(lián)的“魔法”方，在驚險地解決雙方事件的過程中，他的人際關系也逐步擴展。之后，魔法一方的十字教最大宗派羅馬正教，終于注意到上條的存在……。
　　如同呼應魔法方一般，科學方的學園都市也有所動作。但也有與逐漸開始對立的世界動向抗爭的人不斷出現。那些通過與上條有所關聯(lián)，而使命運大為改變的“英雄”們。
　　他們挺身而出與世界對峙。如同上條當麻做過的那樣。
　　科學與魔法第三次交織之時，故事將大幅推進??！

　　電擊文庫最暢銷的輕小說《魔法禁書目錄》曾在2008年10月由J.C.Staff改編成同名TV動畫并大獲好評，其外傳《某科學的超電磁炮》也于09年10月改編成TV動畫，相信不少觀眾早已拜倒在炮姐裙底的安全褲上。5月20日從日本著名的映像出版會社TSUTAYA傳出了2010年秋天動畫二期的圖片。

　　自己的陽臺欄桿上出現了像被單一樣掛在上面的少女，這種非現實的情節(jié)出現在了上條當麻的眼前。雖然在這個城市——最先進科學引導的學院都市中，超能力已經可以通過科學技術創(chuàng)造出來，但是眼前這位自稱“茵蒂克絲”的少女還是把上條當麻嚇了一條。茵蒂克絲自稱因擁有十萬三千本魔導書而被魔法師追殺，而上條當麻靠自己的超能力也認定了少女的魔法。少女以危險為由離開上條家，上條如往日一般去學校學習，但放學回家，卻發(fā)現茵蒂克絲倒在血泊之中。在科學與魔術交叉的世界中，上條當麻與茵蒂克絲的故事開始了。

　　近衛(wèi)昂（井口裕香 配音）家世世代代都作為涼月家的管家而存在，以此與涼月家族形成了深厚的羈絆?？墒?，管家的職位只能由男子擔當，為了延續(xù)祖先的傳統(tǒng)，近衛(wèi)昂女扮男裝隱藏身份，成為了大小姐涼月奏（喜多村英梨 配音）的管家。
　　坂町近次郎是一個普通的男生，由于童年的遭遇，長大后的次郎開始變得無法從容的面對女性，這一現象一般被稱為“女性恐懼癥”。由于這種特質，次郎發(fā)現了近衛(wèi)昂的秘密，為了掩蓋事實，涼月奏以治療其恐懼癥為條件，要求次郎保守這個秘密。從此，在害怕女性的次郎身邊，開始出沒大量外形可愛性格活潑的女生，次郎快樂的校園生活正式開始！

　　結城頼（森久保祥太郎 配音）和結城郁（中原麻衣 配音）是一對雙胞胎兄妹，感情十分要好的兩人甚至在童年時期許下了結婚的懵懂諾言?？墒?，隨著年歲的增長，郁發(fā)現曾經溫柔的頼對自己的態(tài)度越來越冷淡，著讓她感到十分的疑惑。
　　頼和一直追求自己的女生楠友華（川上倫子 配音）開始了交往，但這更讓他感受到對妹妹的無法遏制的感情。同時，哥哥交女朋友的消息也讓郁開始逐漸正視起了自己心中的不安和騷動，幾經波折，兄妹二人終于相互吐露的心聲。然而，這是一段注定要受到斥責和詛咒的愛情，世界如此之大，卻也容不下小小的，相愛的兩人。在痛苦和絕望之中，兄妹二人會做出怎樣的選擇呢？

　　ただし第11話が原作『ドライ!!』4巻の限定版にOADとして付屬する。

　　Fate/kaleid liner プリズマ☆イリヤ ドライ!! 單行本第六卷限定版同捆OAD

　　第四季特典動畫短篇，共6話，每話5分鐘。
　　BD&DVD卷數//發(fā)售日//收錄特典日文標題//中文標題
　　1//2016年9月30日//小學生達の○○修行//小學生們的○○修行
　　2//2016年10月28日//実踐サバイバル術//實踐生存術
　　3//2016年11月25日//著替えよ、さらば思い出さん//換裝吧，再見了回憶
　　4//2016年12月23日//絶対負けるもんですか！//怎么可能會輸！
　　5//2017年1月27日//エリカのねまき研究//艾莉卡的睡衣研究
　　6//2017年2月24日//ルビーの衛(wèi)宮邸浴場観察録//紅寶石的衛(wèi)宮宅浴場觀察錄

　　五集內容分別為：
　　映像特典「OVA1 ビースト、再び！」
　　映像特典「OVA2 無限の服製」
　　映像特典「OVA3 乙女よ闘志を抱け(前編)」
　　映像特典「OVA4 乙女よ闘志を抱け(後編)」
　　映像特典「OVA5 バゼットはじめてのアルバイト」

　　第二季特典動畫短篇，共5話，每話5分鐘。
　　映像特典
　　第2期
　　BD&DVD卷數//發(fā)售日//收錄特典日文標題//中文標題
　　1//2014年9月26日//ファーストブラ イリヤ編//第一次穿胸罩 伊莉雅篇
　　2//2014年10月31日//ファーストブラ 美游編//第一次穿胸 罩 美游篇
　　3//2014年11月28日//おねえちゃんの人肌治療//姐姐的人肌治療
　　4//2014年12月26日//小學生チャイナドレス
　　5//2015年1月30日//魔法少女プリズマ×××