セラフィム指揮官ライアー等人用空間跳躍的方式將宇宙站ウォッチャーズ ネスト的居住區(qū)整個(gè)轉(zhuǎn)送到了地球圈，卻發(fā)現(xiàn)地球被一層時(shí)間屏障覆蓋。為了查明真相，ライアー決定沖進(jìn)時(shí)間屏障，卻進(jìn)入了另一個(gè)時(shí)間軸……

　　紅葉みさき等四名少女是特殊部隊(duì)“セラフィム”的候補(bǔ)生，為了成為正式成員而在ウォッチャーズ ネスト聞雞起舞。但是她們并不知道，真正的敵人異型生命體“グール”有多么可怕……

　　透が紫呉の家に住み始めてから一年が経とうとしていた。
　　由希と夾だけでなく草摩家の皆とも交流を深めてきたが、
　　今も気になるのは忌まわしき『呪い』の正體。
　　進(jìn)むべき道、決められた宿命、
　　終わりなき――十二支の――宴を前にして
　　由希は、夾は、そして透は何を想い、何を決意するのだろうか……。

　　一天，工藤大器偶然聽(tīng)到了神秘聲音的呼喚，與朋友們一起來(lái)到了數(shù)碼世界，在那里認(rèn)識(shí)了眾多的數(shù)碼獸同伴并且成為指揮官建立“Xros Heart”團(tuán)隊(duì)。意想不到的是，在數(shù)碼世界中除了他們外竟然還有別的人類在數(shù)碼世界中活躍著……然而，為了防止邪惡的巴古拉軍企圖稱霸數(shù)碼世界，他們將要努力地收集水晶（Code Crown）來(lái)保護(hù)各個(gè)領(lǐng)域（Zone），擔(dān)負(fù)起拯救數(shù)碼世界的命運(yùn)。
　　被巴古拉獸擊回到人類世界的工藤大器和高吼獸，經(jīng)過(guò)東京大決戰(zhàn)留在人類世界一天后，相對(duì)地?cái)?shù)碼世界已經(jīng)過(guò)了好幾個(gè)月的時(shí)間，并落入了巴古拉軍支配下的地獄世界，分裂為七個(gè)國(guó)家（Land），由七名巴古拉軍手下的死亡指揮官所統(tǒng)治，而這七名死亡指揮官就是本篇章的主要敵人。為了讓數(shù)碼世界再次得到和平，工藤大器和高吼獸決定再次回到危機(jī)四伏的數(shù)碼世界中。此外，本篇章亦出現(xiàn)全新力量“超進(jìn)化”。
　　與巴古拉獸的最終決戰(zhàn)已經(jīng)過(guò)去了一年，天野音音的弟弟-天野悠入讀大器所讀的中學(xué)，并與大器組成“Xros Heart”的籃球隊(duì)，過(guò)著悠閑的生活，而隊(duì)伍中還有一名尊敬著大器學(xué)長(zhǎng)的成員-明石激。一天，明石激被卷入了“數(shù)碼晶界”所發(fā)生的異變之中。

　　2020年，網(wǎng)絡(luò)對(duì)于如今人們的生活而言已經(jīng)是不可或缺的一部分。但是，人類所不知道的是，在網(wǎng)絡(luò)的另一面有著一個(gè)無(wú)限的世界——數(shù)碼世界，以及居住在其中的數(shù)碼獸……以首都圈為中心發(fā)生了大規(guī)模網(wǎng)絡(luò)故障，亂閃的信號(hào)燈、亂碼的室外屏幕……新聞上報(bào)道是網(wǎng)絡(luò)恐怖襲擊。故事的主人公是住在東京近郊高層公寓的小學(xué)五年級(jí)生八神太一。為了準(zhǔn)備周末的夏令營(yíng)而一個(gè)人留在家中，去澀谷的母親和妹妹八神光乘上了一輛無(wú)法停止的電車(chē)。為了救母親和妹妹，太一急忙趕往澀谷，當(dāng)他前往車(chē)站月臺(tái)的瞬間發(fā)生了不可思議的現(xiàn)象，太一去了數(shù)碼世界！孩子們與搭檔數(shù)碼獸相遇，一同面對(duì)未知的“冒險(xiǎn)”！

　　圣（石川由依 配音）是有些沉迷于工作的20歲OL，一天，加班結(jié)束后的她在誤打誤撞之中被傳送到了異世界，成為了那里的圣女。和圣一起被傳送過(guò)來(lái)的，還有其他人，在感到被冷落之后，圣決定暫時(shí)放下圣女的職責(zé)，跑出了王宮，開(kāi)始了隨心所欲的生活。
　　圣非常喜歡植物，憑借著這份熱愛(ài)，圣隱瞞了自己的身份，來(lái)到了藥用植物研究所工作，并且在這里遇見(jiàn)了善良的所長(zhǎng)約翰（江口拓也 配音）和導(dǎo)師裘德（八代拓 配音），在兩人的幫助之下，圣的工作逐漸步入了正軌。受到圣身上圣女力量的影響，圣所制作出的所有藥水都擁有了50%的增益，這使得圣在當(dāng)?shù)貪u漸樹(shù)立了口碑，獲得了信賴。

　　勝出與BC自由學(xué)園對(duì)決的首戰(zhàn)后，大洗女子學(xué)園戰(zhàn)車(chē)道部進(jìn)入冬季大會(huì)「無(wú)限軌道杯」的第二輪比賽。面對(duì)以「突擊」戰(zhàn)法來(lái)勢(shì)洶洶的知波單學(xué)園，大洗女子學(xué)園迎來(lái)苦戰(zhàn)！叢林加夜戰(zhàn)，被逼到絕境的美穗等人會(huì)有扭轉(zhuǎn)局面的對(duì)策嗎？
　　與此同時(shí)，亦不能錯(cuò)過(guò)其他學(xué)校的對(duì)決！黑森峰女子學(xué)園VS真理學(xué)園、圣葛羅莉安娜女子學(xué)院VS安齊奧高中，這兩場(chǎng)對(duì)決的結(jié)果同樣無(wú)法預(yù)料！
　　逐漸白熱化的無(wú)限軌道杯，獲得勝利的會(huì)是誰(shuí)??？

　　在賭上學(xué)校存續(xù)的大學(xué)選拔隊(duì)?wèi)?zhàn)役中勝利後，大洗女子學(xué)園戰(zhàn)車(chē)道成員終於能好好享受和平悠閑的冬季。迎接三年級(jí)生畢業(yè)典禮的到來(lái)，包含學(xué)生會(huì)改選與新執(zhí)行部門(mén)的動(dòng)作，學(xué)校開(kāi)始發(fā)生些微的變化。有一天，一場(chǎng)騷動(dòng)來(lái)訪少女們。為了下一波難題與困難，戰(zhàn)車(chē)道成員們?cè)俅瓮ι矶鲇犹魬?zhàn)。

　　高中一年級(jí)學(xué)生，小牧嬉歌。不擅長(zhǎng)的事，有許多。 喜歡做的事，唱歌。 為了追求普通人的青春，在升入高中時(shí)嘗試改變形象加入輕音部，但膽小的性格導(dǎo)致了最終以失敗收?qǐng)觥?在失意之中，嬉歌遇見(jiàn)了只用人聲創(chuàng)作的音樂(lè)【阿卡貝拉】。只有通過(guò)重疊的聲音才能彼此相連的，少女們不美好的青春就在那里。 ――不閃耀，亦青春。

　　超一流冒険者パーティーを追放されたデニスは、元奴隷の美少女アトリエと出會(huì)い、夢(mèng)であった自分の食堂を開(kāi)店することに。しかし、その扉を叩くのはなぜか問(wèn)題を抱えたクセ者ばかりだった！ お人好しのデニスは、“至高の料理”でお客の腹を満たし、“最強(qiáng)の料理スキル”で彼らの抱える問(wèn)題の解決に挑むのだが……。肉切り包丁で悪黨をなぎ倒し、中華鍋で仲間を守る !? ここは、心もお腹も満たされる場(chǎng)所――『冒険者食堂』!!

　　二階堂明本來(lái)是個(gè)笑起來(lái)很陽(yáng)光的男孩，很受歡迎。但初中一次意外事件，給他留下了嚴(yán)重的心理創(chuàng)傷。上高中后，他整個(gè)人變得死氣沉沉，也不與人打交道，猶如從伊藤潤(rùn)二漫畫(huà)中走出的男子，傳聞跟他搭話就會(huì)變成禿頭。大家對(duì)他避之不及，但偏偏有人不信邪，要去找他搭訕……